经过整治手续后，甲骨就可以拿来占卜了。

占卜的方式是先由贞人说明卜问内容，就是所谓的“命龟”。然后用烧红的树枝在钻的地方烧灼，接着甲骨会发出“卜”的一声，同时在正面出现一个像“卜”字形的卜兆，这也是“卜”字的由来，后来便用以指称占卜之事。贞人根据卜兆的兆象来判断事情吉凶，也就是习称的“占龟”。

经过命龟、烧灼以及占龟的手续后，就要将占卜的事情契刻在甲骨上面了。甲骨的刻辞或书辞，通常都在相关卜兆附近，刻辞会随着占卜事情的重要程度不同，而填上不同颜色的颜料，通常比较重要的占卜或字体比较大的会填入红色颜料，也就是所谓的“涂朱”，大部分小字则是填入黑色颜料，又称为“涂墨”，另外还有涂紫、涂黄、涂赭等各式各样的颜色。除了字体之外，商人为了让卜兆更加显眼也会加以契刻并填入颜料。

总而言之，殷墟甲骨的占卜除了刮磨、整治、钻凿等准备工作。还有命龟、烧灼、占龟、刻兆、刻辞、涂饰等占卜工作，整个过程虽然烦琐，但是井然有序，显示出占卜在商朝已经是个具有规范性与成熟性的行为。

至于商代人又是如何处理占卜完的甲骨呢？他们通常都是先将甲骨集中储存后一起掩埋到土里，于是就会有一整个堆满甲骨的大土坑，其中最有名的就是殷墟YH127坑。坑中的甲骨是一次性倒入，可见这些甲骨是经过长期集中保存，然后才一次处理掉的。YH127坑除了出土大量的甲骨片，同时还发现甲骨旁边有一具完整的人骨，可能是掌管这些废弃甲骨的管理员，因为这些甲骨已经废弃不用，所以就跟着殉葬了。

除此之外，花园庄东地以及小屯南地甲骨也都是掩埋坑。花园庄东地H3坑是一个长方形的掩埋坑，出土的一千五百八十三片甲骨都是属于某个贵族“子”的卜辞，可见是专门为掩埋甲骨而挖掘的。甲骨放置的情况是先将一些完整的卜甲竖直，放在掩埋坑的角落，然后再将大量的甲骨倒进坑内，最后用泥土掩埋加以打实。至于小屯南地的甲骨，主要集中掩埋于五个坑之中，都是层层堆栈地放入坑中，大部分都是完整无缺的大版牛肩胛骨，只有少量的卜甲，此外没有其他的遗物，可见也是当时人们刻意挖掘的一个埋藏甲骨的窖穴。

由此可见，商朝人占卜后通常不会立刻扔掉甲骨，而是有意识的集中储存一段相当长的时间，然后才一起掩埋处理的。有些文献也曾记载商朝人的这个习惯，例如《礼记·曲礼上》就说“祭服敝则焚之，龟筮敝则埋之”，而郑玄作注时也说：“此皆不欲人亵也。”可见经过占卜后的甲骨即使没有任何用途，商朝人也不希望随意弃置，遭到别人的破坏。

商朝人对于甲骨的珍重，还表现在一件有趣的事情上，那就是“废物利用”。根据学者的研究发现，殷墟出土了不少只是契刻“干支表”或是无意义文字的甲骨，这些甲骨可能早已废弃不用，于是就拿来给学生们练习，不仅能够节约还相当具有环保概念呢！（摘自《甲骨文的故事》董作宾，董敏 著 海南出版社）